Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scnn1bQ9WU38 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scnn1bQ9WU38 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms