Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trpv2Q9WTR1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trpv2Q9WTR1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms