Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trpc2Q9R244 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trpc2Q9R244 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms