Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TapbpQ9R233 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms