Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcm1Q9R0L6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms