Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nek3Q9R0A5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek3Q9R0A5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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