Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh2d3cQ9QZS8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms