Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Col4a4Q9QZR9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Col4a4Q9QZR9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Col4a4Q9QZR9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Col4a4Q9QZR9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Col4a4Q9QZR9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Col4a4Q9QZR9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Col4a4Q9QZR9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Col4a4Q9QZR9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Col4a4Q9QZR9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Col4a4Q9QZR9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col4a4Q9QZR9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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