Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VapbQ9QY76 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VapbQ9QY76 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms