Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nphp1Q9QY53 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nphp1Q9QY53 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms