Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pkp3Q9QY23 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms