Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lsm4Q9QXA5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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