Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clca3a1Q9QX15 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms