Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tcea2Q9QVN7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms