Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mid2Q9QUS6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms