Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms