Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUI0

Rhoa, Transforming protein RhoA, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoaQ9QUI0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RhoaQ9QUI0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RhoaQ9QUI0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms