Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdc42ep4Q9JM96 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdc42ep4Q9JM96 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms