Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rabgef1Q9JM13 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rabgef1Q9JM13 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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