Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tlr5Q9JLF7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tlr5Q9JLF7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr5Q9JLF7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms