Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Tgm1Q9JLF6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tgm1Q9JLF6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tgm1Q9JLF6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tgm1Q9JLF6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Tgm1Q9JLF6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tgm1Q9JLF6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tgm1Q9JLF6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm1Q9JLF6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms