Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gde1Q9JL56 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms