Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Upk3aQ9JKX8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Upk3aQ9JKX8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms