Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms