Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Msgn1Q9JK54 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Msgn1Q9JK54 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms