Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Tuba8Q9JJZ2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tuba8Q9JJZ2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tuba8Q9JJZ2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tuba8Q9JJZ2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms