Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnmb4Q9JIN6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnmb4Q9JIN6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms