Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lgi1Q9JIA1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lgi1Q9JIA1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms