Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHR9

Nrip2, Nuclear receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip2Q9JHR9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nrip2Q9JHR9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms