Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ropn1Q9ESG2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ropn1Q9ESG2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms