Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cmtm7Q9ESD6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cmtm7Q9ESD6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms