Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp29Q9ES63 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp29Q9ES63 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Usp29Q9ES63 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Usp29Q9ES63 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp29Q9ES63 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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