Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SelenofQ9ERR7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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