Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Chrnb2Q9ERK7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms