Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx12Q9ER00 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stx12Q9ER00 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms