Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SgshQ9EQ08 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SgshQ9EQ08 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms