Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf21Q9EPU5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms