Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufs3Q9DCT2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs3Q9DCT2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs3Q9DCT2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs3Q9DCT2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs3Q9DCT2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs3Q9DCT2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufs3Q9DCT2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms