Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Hmg20aQ9DC33 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hmg20aQ9DC33 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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