Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tm9sf1Q9DBU0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms