Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SelenooQ9DBC0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms