Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pop5Q9DB28 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pop5Q9DB28 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms