Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sgf29Q9DA08 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms