Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34b2Q9D9N2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34b2Q9D9N2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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