Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cntd1Q9D995 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cntd1Q9D995 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms