Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifrd2Q9D8U0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifrd2Q9D8U0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms