Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SlirpQ9D8T7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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