Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tvp23bQ9D8T4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms