Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl17Q9D8P4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl17Q9D8P4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl17Q9D8P4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl17Q9D8P4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl17Q9D8P4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl17Q9D8P4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl17Q9D8P4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl17Q9D8P4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl17Q9D8P4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl17Q9D8P4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl17Q9D8P4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms