Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fip1l1Q9D824 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fip1l1Q9D824 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms